Thesis, Dissertations & Patents
Lista da 143 Orientações e Supervisões Concluidas dos Pesquisadores Principais (2019-2014)
2019
Iniciação científica
1. Renan de Assis Santos Sebastiao. Introdução ao Estudo de Simulações Computacionais em Sistemas com Interesse em Nanobiotecnologia. 2019. Iniciação Científica. (Graduando em Abi - Física) - Universidade de São Paulo, Universidade de São Paulo / Pró-Reitoria de Cultura e Extensão Universitári. Orientador: Helena Maria Petrilli.
2. Pamela Costa Carvalho. Magnetismo em multicamadas metálicas através de cálculos de estrutura eletrônica ab-initio e dinâmicas de spins. 2019. Iniciação Científica. (Graduando em Abi - Física) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Helena Maria Petrilli.
3. Tiago Vicentini Ferreira do Valle. Introdução ao nanomagnetismo através de simulações computacionais. 2019. Iniciação Científica. (Graduando em Abi - Física) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Helena Maria Petrilli.
4. Alexsander Carvalho Vendite. Estudos Teóricos de Captura de CO2 em Nanoporos Estruturados Umedecidos. Início: 2019. Iniciação científica (Graduando em Física) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Kaline Rabelo Coutinho. BOLSISTA BIOMOL/CAPES
Dissertação de mestrado
1. Vitocley Bezerra de Moraes. Estudo Computacional da Metilação de Nitronatos [R1R2CNO2]− em Solução: Mecanismo e Seletividade. 2019. Dissertação (Mestrado em Quimica) - Universidade Federal Rural de Pernambuco. Coorientador: Ricardo Luiz Longo.
2. Sanderson Hudson da Silva Malta. Modelagem Computacional da Hidrólise e do Potencial Redox de Aquacomplexos de íons Ce3+, Ce4+, Eu2+ e Eu3+. 2019. Dissertação (Mestrado em Ciência de Materiais) - Universidade Federal de Pernambuco. Orientador: Ricardo Luiz Longo.
3. Matheus Vitor Ferreira Ferraz. Engenharia de Anticorpos Artificiais Baseados em VHH Contra a NS1 do Vírus Zika para Uso em Diagnóstico Sorológico Diferencial. 2019. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Roberto Dias Lins Neto.
4. Matheus Jean Lazarotto. Estudo Teórico de Anisotropia de Fluorescência de uma Sonda em Meio Solvente e em Bicamada Lipídica, http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-22042019-095222/p..., defesa em 28/03/2019. 2019. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Kaline Rabelo Coutinho. BOLSISTA BIOMOL/CAPES
Tese de doutorado
1. Keyla Mirelly Nunes de Souza. Termometria em Escala Nanométrica com Novos Materiais Lantanídicos. 2019. Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Ciências de Materiais) - Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Ricardo Luiz Longo.
2. Paulo McMiller Crisostomo de Oliveira. Estrutura e Propriedades Topológicas de Redes de Ligação de Hidrogênio em Líquidos: Água, Água Confinada, HCN e HNC. 2019. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Ricardo Luiz Longo.
3. Diego José Raposo da Silva. Termodinâmica de solvatação: implicações, aplicações e generalizações. 2019. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Ricardo Luiz Longo.
Supervisão de pós-doutorado
1. Henrique Musseli Cezar. 2019. Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Kaline Rabelo Coutinho. BOLSISTA BIOMOL/CAPES
2018
Iniciação científica
1. Stephanie Borges Vieira. Estrutura da Água e Soluções Iônicas na Cavidade de Micela Reversa. 2018. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. Orientador: Ricardo Luiz Longo.
2. Isabella de Melo Silva Rosado. Análises do recobrimento de ligações químicas covalentes e aplicações em química. 2018. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado e Licenciatura em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. Orientador: Ricardo Luiz Longo.
3. Matheus Vitor Ferreira Ferraz. Interação entre peptídeos e superfícies minerais com aplicação no desenvolvimento de biobaterias. 2018. Iniciação Científica. (Graduando em Engenharia Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Roberto Dias Lins Neto.
4. Madson Allan de Luna Aragao. Mapeamento das interações do complexo trimérico E6-E6AP-p53 responsáveis pela oncogênese mediada por HPV. 2018. Iniciação Científica. (Graduando em Biomedicina) - Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Roberto Dias Lins Neto. BOLSISTA BIOMOL/CAPES
5. Raquel Eufrásio Medeiros Lins. Dinâmica Molecular de Metal-Organic Frameworks. 2018. Iniciação Científica. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva. BOLSISTA BIOMOL/CAPES
6. Manuela Nader. Desenvolvimento de ferramentas computacionais para análise de propriedades dependentes de curvatura de superfícies. 2018. Iniciação Científica. (Graduando em Engenharia) - Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
7. Pamela Costa Carvalho. Introdução ao nanomagnetismo através de simulações computacionais. 2018. Iniciação Científica. (Graduando em Física) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Helena Maria Petrilli.
8. Tiago Vicentini Ferreira do Valle. Introdução a Simulações Computacionais em Sistemas com Interesse em Nanociência. 2018. Iniciação Científica. (Graduando em Abi - Física) - Universidade de São Paulo, Universidade de São Paulo / Pró-Reitoria de Cultura e Extensão Universitári. Orientador: Helena Maria Petrilli.
Dissertação de mestrado
1. Vinicius Jardim Carvalho. BioNetStat: Uma ferramenta para análise diferencial de redes biológicas. 2018. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: André Fujita.
2. Jessica Itaiane Ramos de Souza. Modelagem Computacional de Complexos Luminescentes com Íons Lantanídeos e Beta-dicetonatos. 2018. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Ciência de Materiais) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Ricardo Luiz Longo.
3. Thiago Estefane da Silva. Planejamento de Compostos Luminescentes Fotoestáveis com Íons Lantanídeos. 2018. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. Orientador: Ricardo Luiz Longo.
4. Sarah Emanuelle Pereira da Silva. Estudo da Fluxionalidade Estrutural e da Labilidade da Água em Complexos com Íons Lantanídeos e EDTA. 2018. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Ciência de Materiais) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. Orientador: Ricardo Luiz Longo.
5. Marjorie Caroline Liberato Cavalcanti Freire. PREDIÇÃO E CARACTERIZAÇÃO ESTRUTURAL DE EPÍTOPOS DO VÍRUS ZIKA. 2018. Dissertação (Mestrado em Pós-graduação em Biociências e Biotecnologia em Saúde) - Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães, FIOCRUZ, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Roberto Dias Lins Neto. BOLSISTA BIOMOL/CAPES
Tese de doutorado
1. Adèle Helena Ribeiro. Identification of causality in genetics and neuroscience. 2018. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: André Fujita. BOLSISTA BIOMOL/CAPES
2. Gabriela Eleutério Soares. Testes estatísticos semi-paramétricos para discriminação e grafos. 2018. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: André Fujita.
3. Danilo Fernandes Coêlho. ENGENHARIA, CARACTERIZAÇÃO ESTRUTURAL E AVALIAÇÃO IMUNOLÓGICA DE ANTÍGENOS DE DENV, ZIKV E HIV-1. 2018. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Roberto Dias Lins Neto.
4. Amanda Lima Barros. Identificação de Metal-Organic Frameworks com Potencial para o Carreamento de Fármacos: Uma Conexão entre Experimento e Teoria. 2018. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
5. Henrique Musseli Cezar. Implementação e desenvolvimento de algoritmo eficiente para deformação intramolecular com o método Monte Carlo (http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-19102018-165856/p...). 2018. Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Kaline Rabelo Coutinho.
Supervisão de pós-doutorado
1. Abner Cardoso Rodrigues Neto. 2018. Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. André Fujita.
2. Diego de Paula Santos. 2018. Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Ricardo Luiz Longo.
3. Laércio Pol Fachin. 2018. Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães, FIOCRUZ, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Roberto Dias Lins Neto.
4. Carlos Henrique Bezerra Cruz. 2018. Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Roberto Dias Lins Neto. BOLSISTA BIOMOL/CAPES
5. Gabriel Alverni Costa da Hora. 2018. Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Thereza Amélia Soares da Silva. BOLSISTA BIOMOL/CAPES
6. Fernando da Silva. 2018. Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Kaline Rabelo Coutinho. BOLSISTA BIOMOL/CAPES
7. Henrique Musseli Cezar. 2018. Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Kaline Rabelo Coutinho. BOLSISTA BIOMOL/CAPES
2017
Iniciação científica
1. Bruno Henrique de Sousa Leite. Avaliação da estrutura e imunoreatividade de proteínas quiméricas carreando epítopos estruturais de ZIKV. 2017. Iniciação Científica - Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães, FIOCRUZ, Fundação Oswaldo Cruz. Orientador: Roberto Dias Lins Neto.
2. Larissa Dias da Silva. Design de Novos Antagonistas da Enzima 3-Hidróxi-Quinurenina Transaminase de Aedes Aegypti. 2017. Iniciação Científica. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva. BOLSISTA BIOMOL/CAPES
3. Andresa Messias da Silva. Simulações Computacionais de Membranas Bacterianas em Presença do cation Al+3 usado como adjuvante em Vacinas. 2017. Iniciação Científica. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
4. Denis de Assis Pinto Garcia. Introdução ao Estudo de Simulações Computacionais e Propriedades Eletrônicas em Sistemas com Interesse em Nanociência. 2017. Iniciação Científica. (Graduando em Física) - Universidade de São Paulo. Orientador: Helena Maria Petrilli.
5. Athos Mekanna Moraes. Introdução ao Estudo de Simulações Computacionais e Propriedades Eletrônicas em Sistemas com Interesse em Nanociência. 2017. Iniciação Científica. (Graduando em Física) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Helena Maria Petrilli.
6. Thiago de Souza Duarte. Estudos Teóricos das Interações de Fármacos com Nanoporos Estruturados e Hidratados. 2017. Iniciação Científica. (Graduando em Física) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Kaline Rabelo Coutinho. BOLSISTA BIOMOL/CAPES
7. Alexsander Carvalho Vendite. Estudos Teóricos de Captura de CO2 em Nanoporos Estruturados Umedecidos. 2017. Iniciação Científica. (Graduando em Física) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Kaline Rabelo Coutinho.
Dissertação de mestrado
1. Eva Lemmi Giovanini Dialetachi. Espalhamento dinâmico de luz em sistemas coloidais diluídos. 2017. Dissertação (Mestrado em Mestrado em Física) - instituto de Física da Universidade de São Paulo. Orientador: Cristiano Luis Pinto de Oliveira.
2. Taiane Coelho Ramos. Identificação de alterações em conectividades funcionais córtico-cerebelares no transtorno do espectro autista. 2017. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: André Fujita.
3. Jaqueline Yu Ting Wang. Determinação pré-natal não invasiva de paternidade utilizando micro-haplótipos. 2017. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, GENOMIC. Coorientador: André Fujita.
4. Viviane Pereira de Souza. Novos Materiais com Íons Lantanídeos e Ácidos Benzoicos Substituídos. 2017. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Ciência de Materiais) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. Orientador: Ricardo Luiz Longo.
5. Catarina Maria Cataldi Sabino de Araújo. Avaliação Imunológica de Aptâmeros Peptídicos Específicos Contra Epítopos de Anticorpos Neutralizantes do Vírus Zika. 2017. Dissertação (Mestrado em Pós-graduação em Biociências e Biotecnologia em Saúde) - Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães, FIOCRUZ, Fundação de Amparo a Ciência do Estado de Pernambuco. Orientador: Roberto Dias Lins Neto.
6. Antonio Fernando da Purificação Júnior. Expressao de proteinas quimericas contendo epitopos NS1 do virus da dengue para fins diagnosticos e vacinais. 2017. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Genética) - Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: Roberto Dias Lins Neto.
7. Denys Ewerton da Silva Santos. Bases Moleculares da Resistência e Susceptibilidade da Membrana Externa de Bactérias Gram-Negativas à Ação de Peptídeos Antimicrobianos. 2017. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
8. Yeny Yaneth Pillco Valencia. Simulações em Múltiplas-Escalas do Peptídeo Híbrido Pediocina-Plantaricina em Bicamadas Lípidicas. 2017. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Organização dos Estados Americanos e Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva. BOLSISTA BIOMOL/CAPES
9. Adamor Luz Eleiel Virgino. Cálculos ab initio para investigação de propriedades eletrônicas e espectroscópicas de complexos de epiisopiloturina com Cu e Zn. 2017. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo. Orientador: Helena Maria Petrilli.
10. Arthur Prado Camargo. Estudo da ciprofloxacina através de cálculos ab-initio. 2017. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Helena Maria Petrilli.
11. Argel Nasir Sosa Nuñez. Estudo Teórico da Espectroscopia da Clorofila d. 2017. Dissertação (Mestrado em FÍSICA) - Instituto de Física da USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Sylvio Roberto Accioly Canuto.
Tese de doutorado
1. Gustavo Pinto Vilela. Causalidade de Granger entre grafos no domínio da frequência. 2017. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: André Fujita.
2. Fernando Cipriano Andrade Oliveira. Genetic Architecture of genes coding for RNA-binding proteins. 2017. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: André Fujita.
3. Ohana Maria Menezes Madeiro da Costa. Desenvolvimento de Plataformas Lípidicas para o Carreamento de Fármaco: Simulação e Experimento. 2017. Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Ciências de Materiais) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco e Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.. Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva. BOLSISTA BIOMOL/CAPES
Supervisão de pós-doutorado
1. Roman Spirin. 2017. instituto de Física da Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Cristiano Luis Pinto de Oliveira.
2. Ayyaz Mahmood. 2017. Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães, FIOCRUZ, Fundação de Amparo a Ciência do Estado de Pernambuco. Roberto Dias Lins Neto.
3. Fernando da Silva. 2017. Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Kaline Rabelo Coutinho.
4. Evanildo Gomes Lacerda Júnior. 2017. Instituto de Física da USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Sylvio Roberto Accioly Canuto. BOLSISTA BIOMOL/CAPES
Orientações de outra natureza
1. Helena Oestergaard Rasmussen. Mesoporous silica: in situ SAXS investigation of synthesis processes. 2017. Orientação de outra natureza - instituto de Física da Universidade de São Paulo. Orientador: Cristiano Luis Pinto de Oliveira.
2016
Iniciação científica
1. Marcelle Mascarenhas Batista. Cálculo dos Parâmetros de Intensidade de Complexos com Íons Lantanídeos. 2016. Iniciação Científica. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. Orientador: Ricardo Luiz Longo.
2. Stephanie Borges Vieira. Modelagem Molecular da Descarboxilação Assistida por Água e por Micelas. 2016. Iniciação Científica. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. Orientador: Ricardo Luiz Longo.
3. Madson Allan de Luna Aragao. Desenvolvimento e Aplicações de Ferramentas Computacionais para Biologia: da Modelagem Molecular a Pesquisa Translacional. 2016. Iniciação Científica. (Graduando em Biomedicina) - Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Roberto Dias Lins Neto.
4. Thomas Lucena Gouveia. Automatizacão de Procedimentos Computacionais para o Estudo de Processos de Adsorcão de Fármacos em Redes Metalo-Orgânicas (MOFs). 2016. Iniciação Científica. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
5. Arthur Monteiro Falcão. Molecular Docking of New Inhibitors to Angiotensin Converting Enzyme. 2016. Iniciação Científica. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Ministério da Educação. Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
6. Matheus Jean Lazarotto. Estudo Teórico do Espectro Eletrônico de Derivados da Merocianina de Brooker. 2016. Iniciação Científica. (Graduando em Física) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Kaline Rabelo Coutinho.
Dissertação de mestrado
1. Juan Manuel Vidal. Estudo comparativo de duas estratégias utilizadas na busca de relações funcionais entre genes. 2016. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: André Fujita.
2. Paulo Moises Raduan Alexandrino. Reconstrução da rede metabólica em escala genômica da bactéria Burkholderia sacchari. 2016. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: André Fujita.
3. Davi Toshio Inada. Análise do metaboloma da cana-de-açúcar ao longo do ciclo de maturação da planta. 2016. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Coorientador: André Fujita.
4. Grover Enrique Castro Guzman. Identificação de alterações na estrutura de clusterização das redes funcionais do cérebro associadas com o neurodesenvolvimento. 2016. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: André Fujita.
5. Eivson Darlivam Rodrigues de Aguiar Silva. Mecanismo da Reação de Cicloadição entre 1,3-Butadieno e Eteno: Um Estudo Computacional. 2016. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. Orientador: Ricardo Luiz Longo.
6. Marcelo Depólo Polêto. Parametrização de anéis aromáticos comumente usados no desenvolvimento de fármacos e química medicinal. 2016. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: Roberto Dias Lins Neto.
7. José Adriano da Silva. Emprego de Simulações de Dinâmica Molecular para Estudo de Crescimento de Nanopartículas Anisotrópicas. 2016. Dissertação (Mestrado em Química e Biotecnologia) - Universidade Federal de Alagoas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Coorientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
8. Larissa Gonçalves Maciel. 3-Hidróxi-Quinurenina Transaminase de Aedes aegipty: Clonagem, Expressão, Avaliação Funcional e Síntese de Potenciais Inibidores Seletivos. 2016. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Coorientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
9. Ivan de Paula Miranda. Propriedades magnéticas de trímeros de Fe x Co 1-x depositados em Pt (111). 2016. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Helena Maria Petrilli.
10. Ricardo Lima. Propriedades eletrônicas e estruturais de fluidos supercríticos. Avaliação de campos de força para descrição do espectro de absorção da paranitroanilina em CO2 supercrítico. 2016. Dissertação (Mestrado em FÍSICA) - Instituto de Física da USP. Orientador: Sylvio Roberto Accioly Canuto.
Tese de doutorado
1. Abner Cardoso Rofrigues Neto. Caracterização e análise da atividade eletrofisiológica em pacientes com epilepsia. 2016. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: André Fujita.
2. Diego de Paula Santos. Dinâmica molecular de micelas zwitteriônicas: estrutura, adsorção de íons e catálise. 2016. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Ricardo Luiz Longo.
3. Yaicel Gé Proenza. Estudo Computacional do Perfil Energético e Dinâmica de Reações Químicas Bimoleculares. 2016. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. Orientador: Ricardo Luiz Longo.
4. Keila Cristina Cunha e Silva. Simulação Computacional de Biomiméticos de Interesse Biomédico e Nanotecnológico: Peptóides e Catecóis. 2016. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Roberto Dias Lins Neto.
5. Gabriel Alverni Costa da Hora. Simulações Computacionais de Membranas Biológicas e Polímeros Moleculares. 2016. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
6. Fernando da Silva. Estudo Teórico de Complexos de Transferência de Carga em Solução (http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-22112016-121451/). 2016. Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Kaline Rabelo Coutinho.
Supervisão de pós-doutorado
1. Ayyaz Mahmood. 2016. Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Ricardo Luiz Longo.
2. Laércio Pol Fachin. 2016. Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. Roberto Dias Lins Neto.
3. Ricardo Noboru Igarashi. 2016. Universidade de São Paulo. Helena Maria Petrilli.
4. Vinícius Manzoni Vieira. 2016. Instituto de Física da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas. Sylvio Roberto Accioly Canuto.
5. Yansel Omar Guerrero Martínez. 2016. Instituto de Física da USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Sylvio Roberto Accioly Canuto. BOLSISTA BIOMOL/CAPES
6. Evanildo Gomes Lacerda Júnior. 2016. Instituto de Física da USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Sylvio Roberto Accioly Canuto.
2015
Iniciação científica
1. Pedro Ivo Siqueira Nepomuceno. a ser definido. 2015. Iniciação Científica. (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: André Fujita.
2. Marcelle Mascarenhas Batista. Modelagem Molecular de Complexos Diméricos de Íons Lantanídeos Trivalentes com Diferentes Distâncias entre os Íons. 2015. Iniciação Científica. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Ricardo Luiz Longo.
3. Stephanie Borges Vieira. Estudo Computacional de Complexos de Íons Lantanídeos Trivalentes com Ligantes Comerciais. 2015. Iniciação Científica. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Ricardo Luiz Longo.
4. Raquel Eufrásio Medeiros Lins. Simulacões Computacionais de MOFs aplicadas ao Carreamento de Fármacos. 2015. Iniciação Científica. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
5. Denys Ewerton da Silva Santos (Graduando Engenharia Química). Desenvolvimento de Ferramentas Computacionais para Análise de Polimorfismo em Membranas Biológicas. 2015. Iniciação Científica - Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva. BOLSISTA BIOMOL/CAPES
6. Andresa Messias da Silva. Simulações Computacionais de Membranas Bacterianas em Presença do cation Al+3 usado como adjuvante em Vacinas. 2015. Iniciação Científica. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
7. Vanessa Oliveira. A Enzima 3-Hidroxi-Quinurenina Transaminase como Alvo para Compostos Larvicidas 1,2,4-oxadiazois. 2015. Iniciação Científica. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
8. Caio Lorenzetti Martinelli. Introdução ao Estudo de Simulações Computacionais e Propriedades Eletrônicas em Sistemas com Interesse em Nanociência. 2015. Iniciação Científica. (Graduando em Física) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Helena Maria Petrilli.
9. Thiago de Souza Duarte. Desenvolvimento de Interface Gráfica para o Programa DICE. 2015. Iniciação Científica. (Graduando em Física) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Kaline Rabelo Coutinho.
Dissertação de mestrado
1. Eraldo de Sales. Desenvolvimento de Detetores bidimensionais a gás multifilares para raios X. 2015. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo. Orientador: Cristiano Luis Pinto de Oliveira.
2. Renata Naporano Bicev. Estudo Estrutural de Proteínas em solução. 2015. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Cristiano Luis Pinto de Oliveira.
3. Eduardo Cocca Padovani. Caracterização da Estrutura e Dinâmica das Redes Funcionais Neurais Durante um Processo de Indução Anestésica. 2015. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: André Fujita.
4. Suzana de Siqueira Santos. Análise de redes biológicas: estudo comparativo de medidas de dependência e uma ferramenta computacional para discriminar grafos. 2015. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: André Fujita.
5. Eduardo Díaz Suárez. Simulações computacionais de moléculas com aplicações em biociências. 2015. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Helena Maria Petrilli.
6. Tárcius Nascimento Ramos. Efeitos de Solventes nos Espectros de Absorção e Emissão da Dimethoxy Curcumin. 2015. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo. Orientador: Sylvio Roberto Accioly Canuto.
Tese de doutorado
1. CASSIO ALVES. SIMULAÇÃO E MODELAGEM COMPUTACIONAL DE DADOS DE ESPALHAMENTO A BAIXOS ÂNGULOS ? ENFOQUE EM ESTRUTURAS DE ALTA SIMETRIA. 2015. Tese (Doutorado em doutorado em física IFUSP) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Cristiano Luis Pinto de Oliveira.
2. Ayyaz Mahmood. Investigations of Reactivity and Selectivity of Methylation of Nitronates [R¹R²CNO2]?. 2015. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Ricardo Luiz Longo.
3. Filipe Camargo Dalmatti Alves Lima. Interação de moléculas e superfície Au(111). 2015. Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Helena Maria Petrilli.
4. Philippe Alexandre Divina Petersen. ?Simulações computacionais da interação de kinases e ligantes derivados de oxindol?. 2015. Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Helena Maria Petrilli.
5. Marcus Vinicius Araujo Damasceno. Efeitos de Solventes em Espectros de Absorção Eletrônica da Merocianina e Derivados (http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-07042015-145330/). 2015. Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Kaline Rabelo Coutinho.
6. CARLOS EDUARDO BISTAFA DA SILVA. Estudo Teórico de Estados Excitados de Moléculas Orgânicas em Solvente. 2015. Tese (Doutorado em fisica) - Instituto de Física da USP. Orientador: Sylvio Roberto Accioly Canuto.
Supervisão de pós-doutorado
1. Julio Cosme Santos da Silva. 2015. Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Thereza Amélia Soares da Silva.
2. Frederico José Santana Pontes. 2015. Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. Thereza Amélia Soares da Silva. BOLSISTA BIOMOL/CAPES
3. Evanildo Gomes Lacerda Júnior. 2015. Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Kaline Rabelo Coutinho.
4. Antonio Rodrigues da Cunha. 2015. Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Kaline Rabelo Coutinho.
2014
Iniciação científica
1. Marcelle Mascarenhas Batista. Modelagem Molecular de Complexos Diméricos de Íons Lantanídeos Trivalentes e Benzoatos. 2014. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Ricardo Luiz Longo.
2. Stephanie Borges Vieira. Modelagem Computacional de Compostos com Íons Lantanídeos Trivalentes e Ligantes Análogos de beta-Dicetonatos Inorgânicos. 2014. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Ricardo Luiz Longo.
3. Antonio Fernando da Purificação Júnior. Modelagem Racional de Epítopos em Suportes Protéicos. 2014. Iniciação Científica. (Graduando em Biomedicina) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Roberto Dias Lins Neto.
4. Matheus Vitor Ferreira Ferraz. Modelagem de anticorpos de camelídeos. 2014. Iniciação Científica. (Graduando em Engenharia Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo a Ciência do Estado de Pernambuco. Orientador: Roberto Dias Lins Neto. BOLSISTA BIOMOL/CAPES
5. Denys Ewerton da Silva Santos. Simulações Computacionais de Polímeros Moleculares. 2014. Iniciação Científica. (Graduando em Engenharia Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
6. Andresa Messias da Silva. Simulações Computacionais de Membranas Bacterianas em Presença do cation Al+3 usado como adjuvante em Vacinas. 2014. Iniciação Científica. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
7. Raquel Eufreasio Medeiros Lins. Simulacões Computacionais de MOFs aplicadas ao Carreamento de Fármacos. 2014. Iniciação Científica. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva. BOLSISTA BIOMOL/CAPES
8. Arthur Prado Camargo. Estudo estrutural de oligômeros de DNA por meio de dinâmica molecular clássica. 2014. Iniciação Científica. (Graduando em Física) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Helena Maria Petrilli.
Dissertação de mestrado
1. Maciel Calebe Vidal. Análise da estrutura de clusterização das redes de conectividade funcional do cérebro para investigar as bases das desordens do espectro autista. 2014. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: André Fujita.
2. Vinícius Wilian Dias Cruzeiro. Estudos Teóricos do Espectro de Absorção de Porfirinas e Ftalocianinas (http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-25092014-152257/). 2014. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Kaline Rabelo Coutinho.
Tese de doutorado
1. Yuri Gomes de Abreu. Identificação de variáveis associadas a doenças cardiovasculares utilizando técnicas estatístico-computacionais. 2014. Iniciação Científica - Escola Politécnica, Pró-reitoria de pesquisa da Universidade de São Paulo. Orientador: André Fujita.
2. Eduardo de Castro Aguiar. Estudo Sistemático do Confinamento da Ligação de Hidrogênio HCN-HCN em Nanotuvos de Carbono. 2014. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Coorientador: Ricardo Luiz Longo.
3. Daniela Nadvorny. Estudo Teórico de Sistemas Nanocápsulas-Ácido Úsnico. 2014. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. Coorientador: Roberto Dias Lins Neto.
4. Victor Holanda Rusu. Desenvolvimento de campos de força "coarse-grain" para carboidratos. 2014. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Roberto Dias Lins Neto.
5. Rafael Rodrigues do Nascimento. Estudo de propriedades estruturais e hiperfinas em complexos metálicos. 2014. Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Helena Maria Petrilli.
6. Antonio Rodrigues da Cunha. Estudos Teórico e Experimental de Propriedades Estruturais e Eletrônicas da Molécula Emodina em Solvente e em Bicamada Lipídica (http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-02102014-142757/). 2014. Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Kaline Rabelo Coutinho.
7. Lucas Modesto Costa. Um tratamento Multiescala (QM/MM) das Propriedades Espectroscópicas da Tetraciclina e seus Complexos com Mg e Eu em àgua. 2014. Tese (Doutorado em fisica) - Instituto de Física da USP. Orientador: Sylvio Roberto Accioly Canuto.
Supervisão de pós-doutorado
1. Erico Souza Teixeira. 2014. Universidade Federal de Pernambuco. Ricardo Luiz Longo.
2. Marcus Vinícius Pereira dos Santos. 2014. Universidade Federal de Pernambuco. Ricardo Luiz Longo.
3. Júlio Cosme Santos da Silva. 2014. Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Ricardo Luiz Longo.
4. Victor Holanda Rusu. Simulação de materiais biogênicos de interesse nanotecnológico. 2014. Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Roberto Dias Lins Neto.
5. Raquel Milani. Caracterização Molecular de MOFs como carreadores de fármacos. 2014. Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Thereza Amélia Soares da Silva.
6. Frederico José de Santana Pontes. 2014. Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Thereza Amélia Soares da Silva.
7. Luiz Tadeu Fernandes Eleno. 2014. Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Helena Maria Petrilli.
8. Marcos Brown Gonçalves. 2014. Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Helena Maria Petrilli.
9. Rafael Rodrigues do Nascimento. 2014. Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Helena Maria Petrilli.
10. Evanildo Gomes Lacerda Júnior. 2014. Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Kaline Rabelo Coutinho.
11. Yoelvis Orozco Gonzalez. 2014. Instituto de Física da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Sylvio Roberto Accioly Canuto.
Orientações de outra natureza
1. Pedro Lucinio. Introdução a programação. 2014. Orientação de outra natureza. (Ensino Médio) - Colégio Joana D'Arc. Orientador: André Fujita.
2. Rebeca Cohen. Introdução a programação. 2014. Orientação de outra natureza. (Ensino Médio) - Colégio Joana D'Arc. Orientador: André Fujita.
3. Fábio Roberto Sandes da Silva. Modelagem Racional de Epítopos em Suportes Protéicos. 2014. Orientação de outra natureza - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Roberto Dias Lins Neto.