Los alumnos especiales son aquellos matriculados en disciplinas, sin vínculo con el curso de Maestría o de Doctorado de algún Programa de Posgrado de la USP. La inscripción como alumno especial no está vinculada con la admisión en el Posgrado como alumno regular, la cual se da mediante el proceso selectivo. Sin embargo, una vez admitido en el Posgrado, el estudiante podrá solicitar la homologación de disciplinas que fueron cursadas como alumno especial hasta 36 meses antes de la matrícula inicial. En el Programa de Posgrado Interunidades en Enseñanza de las Ciencias es permitido cursar hasta dos semestres como alumno especial, contemplando el límite de una disciplina por semestre (para los estudiantes admitidos, que no han realizado la matrícula inicial y deseen adelantar disciplinas como alumnos especiales, no se aplica ese límite). Para el primer semestre de 2024 para los alumnos especiales están disponibles solamente las disciplinas anexas en el formulario de inscripción.